石英砂选矿提纯工艺流程很多，一般视石英砂中杂质的种类、含量、赋存状态以及产品质量要求等确定。
常见的石英砂选矿提纯工艺流程如下：
1、擦洗—分级、脱泥。
石英砂在风化沉积成矿过程中，大量粘土性矿物和铁质在石英表面形成胶结物或粘连矿物。采用擦洗-分级、脱泥工艺去除粘土杂质矿物、泥质铁及部分薄膜铁则是这类石英砂提纯常用的工艺流程。
2、擦洗—脱泥—磁选。
一般而言，石英砂常见杂质矿物，如褐铁矿、电气石、赤铁矿和黑云母等弱磁性矿及磁铁矿等强磁性矿，只有采用磁选工艺才可降除。实际生产中，多采用湿式强磁机进行选别，磁场强度约在13000奥斯特左右。
3、棒磨擦洗—脱泥—磁选—浮选。
棒磨擦洗工艺的采用，一方面强化了擦洗效果，另一方面由于适量钢棒的存在，可以改变原砂的粒度组成，为石英砂进一步的分选提供了矿物学基础。浮选是为了降除长石，国外多采用加氢氟酸浮选。
4、棒磨擦洗—脱泥—磁选—浮选—酸浸。
石英砂原矿在经擦洗、磁选和浮选分离后，赋存较多的杂质矿物颗粒（包括单体、集合体）已基本上被清除干净，SiO2纯度一般可以达到99.5-99.9%，基本上可以满足石英砂的大多数工业用途。但要进一步作为高纯石英砂，就需要对以斑点和包裹体形式连生在石英颗粒表面上的杂质作酸浸处理，根据其不同的工业用途对石英砂不同杂质矿物（Fe、Al、Ti、Cr）的要求，进行不同浓度、配比的混合酸酸浸处理。
5、加药擦洗—分级脱泥—磁选
通过对云南某石英砂岩矿选矿提纯作了详细深入的试验研究之后，我们使用加药擦洗—分级脱泥—磁选这一新的提纯工艺，并获得成功。该工艺是对现有擦洗设备的结构进行了改进，优化了技术参数，通过加药擦洗和分级脱泥可除去80%以上得杂质铁和铝矿，磁选主要是除去含铁杂质矿物。
通过该流程处理后，可获得SiO2≥99.8%，Fe2O3≤0.023%，Al2O3≤0.05%，TiO2≤0.02%的优良精制石英砂，达到了一等光学玻璃用砂的要求，并且精砂的产率高达73%，而棒磨擦洗产率仅为49%，SiO2回收率为72.8%。再进行进一步的浮选和酸浸处理，能获得SiO2≥99.9%，Fe2O3≤0.005%，Al2O3≤0.05%，TiO2≤0.02%的高纯石英砂，这一工艺的采用，克服了棒磨擦洗带来的铁质二次污染、产率低等缺点。
