水发黄有多种不同的现象，一类是井水抽上来，刚开始水质很清澈，但静置一会后变黄或者变红，另一类是从水井抽上来就已经发黄。
现在就这两个现象来单独说明原因：
一类现象的原因是，井水中含有二价铁离子或锰离子，二价铁离子在空气中跟氧气接触发生氧化反应，二价铁离子氧化变为三价铁离子时，水的颜色就变为黄色，但如果是锰超标，也是同样原因，只是锰离子氧化后的颜色是红色。
二类现象的原因则有多重可能性，有可能是水中含有较多细小黄泥，这种现象大家都很容易区分出来，因为黄泥属于悬浮物，颗粒比较大，静置一会后很容易沉淀下来。另一个可能就是井体所采用的管道是铁的，使用时间较长时，管道被氧化，附着在管道上的氧化物在抽水时被带出。
处理工艺为：原水（地下水/江河水）→沉淀池（曝气（鼓风机）/加药（明矾、聚合氯化铝））→增压泵→多介质过滤器（滤料：石英砂（2-4目/4-6目）/锰砂/SS滤料）→活性炭过滤器（滤料：椰壳碳/果壳碳/煤质碳）→用水点（达国家自来水标准）。
石英砂过滤是在水精制处理之前，预先进行的初步处理，以便在水精处理时取得良好效果，提高水质。因为自来水中都含有一定量杂质，如泥沙、铁锈、红虫、有机物、微生物、机械杂质等，这些杂质的存在，严重影响精制水的水质与处理效果，因此，需要在精处理前将一些杂质降低或去除，这就需要预处理。通过石英砂预处理之后，可以使水浊度、色度、胶体物、有机物、铁、锰、微生物、挥发性物质、溶解的气体等杂质除去或降低到一定程度。
活性碳一般情况下可把自来水中的余氯吸附去除98%以上，此外，活性碳表面有大量的羟基和羧基等官能团，可以对各种性质的有机物质进行化学吸附，以及静电引力作用，因此，活性碳还能去除水中对阴离子交换剂有害的腐殖酸、富维酸、木质磺酸等有机物，从而提高了除盐水处理能力。通常能够去除63%-86%胶体物质，50%左右的铁，以及47%-60%的有机物。
处理后的清水：
优于国家饮用水卫生标准，含铁量≤0.3mg/L、含锰量≤0.1mg/L。
铁超标井水特征：
1、井水变黄，清澈井水抽到池中几小时至1天后变成浅黄色。
2、井水中有黄色沉淀，经几天后池底沉淀出黄色铁泥，池壁也染成黄色。
3、如烧开后水则变成微黄色，含铁越高黄色越深。
4、井水有油膜，水面漂浮油膜样物质，并有少许反光亮点。
5、井水有腥味，刚抽上的井水有明显铁腥味。
锰超标井水特征：
1、锰的染色能力相对较弱，在同时有铁超标时看不出锰的染色。
2、单独锰超标时，则会将池壁和用水处的地面染成黑色，并且会有类似脱层的现象。
3、洗衣物会使衣物颜色变暗。
